Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01673 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01673 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01673 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01673 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01673 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01673 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01673 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01673 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01673 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01673 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01673 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01673 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01673 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01673 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01673 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01673 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01673 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01673 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms