Protein–RNA interactions for Protein: P01671

Ig kappa chain V-III region PC 7175, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01671 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01671 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01671 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01671 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01671 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01671 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01671 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01671 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01671 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01671 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01671 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01671 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01671 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01671 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01671 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01671 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01671 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01671 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01671 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01671 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01671 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01671 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01671 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01671 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01671 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01671 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01671 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01671 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01671 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01671 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01671 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms