Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P01649 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P01649 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P01649 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P01649 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01649 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms