Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
JtbO88824 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
JtbO88824 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
JtbO88824 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
JtbO88824 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
JtbO88824 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
JtbO88824 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
JtbO88824 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
JtbO88824 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
JtbO88824 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
JtbO88824 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
JtbO88824 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms