Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tom1O88746 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tom1O88746 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tom1O88746 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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