Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klc1O88447 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms