Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AurkcO88445 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AurkcO88445 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AurkcO88445 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms