Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtssO70370 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CtssO70370 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtssO70370 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtssO70370 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtssO70370 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtssO70370 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms