Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb5O70309 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb5O70309 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms