Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SgceO70258 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SgceO70258 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SgceO70258 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SgceO70258 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SgceO70258 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SgceO70258 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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