Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Eif6O55135 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eif6O55135 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Eif6O55135 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Eif6O55135 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms