Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap2O55126 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms