Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnk2O54967 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnk2O54967 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnk2O54967 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnk2O54967 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnk2O54967 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnk2O54967 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnk2O54967 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnk2O54967 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnk2O54967 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnk2O54967 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnk2O54967 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnk2O54967 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnk2O54967 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms