Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb3O54890 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb3O54890 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms