Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnk2a2O54833 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk2a2O54833 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms