Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DffaO54786 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DffaO54786 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DffaO54786 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DffaO54786 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DffaO54786 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DffaO54786 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DffaO54786 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DffaO54786 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms