Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srpk2O54781 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srpk2O54781 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms