Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Phox2bO35690 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms