Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npc1O35604 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Npc1O35604 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms