Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc27a2O35488 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms