Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1dO35473 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1dO35473 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1dO35473 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1dO35473 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1dO35473 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1dO35473 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1dO35473 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1dO35473 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1dO35473 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1dO35473 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1dO35473 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1dO35473 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1dO35473 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1dO35473 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1dO35473 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C1dO35473 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms