Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh2d1bO35324 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d1bO35324 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms