Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc16a8O35308 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc16a8O35308 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms