Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe40O35185 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe40O35185 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms