Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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