Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epha8O09127 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epha8O09127 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms