Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm20939L7N243 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gm20939L7N243 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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