Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm8888J3QPX5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm8888J3QPX5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm8888J3QPX5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm8888J3QPX5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm8888J3QPX5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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