Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm21976J3QNN2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm21976J3QNN2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm21976J3QNN2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm21976J3QNN2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm21976J3QNN2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm21976J3QNN2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm21976J3QNN2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm21976J3QNN2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm21976J3QNN2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm21976J3QNN2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21976J3QNN2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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