Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930544D05RikJ3QK56 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930544D05RikJ3QK56 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms