Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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