Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf4bG5E8Z2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4bG5E8Z2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms