Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arfgef1G3X9K3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arfgef1G3X9K3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms