Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zc3h12bG3X9I7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zc3h12bG3X9I7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms