Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ercc6F8VPZ5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms