Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
D430041D05RikF6ZGR6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
D430041D05RikF6ZGR6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms