Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933403O08RikF6UK53 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms