Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf165E9QAU8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf165E9QAU8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf165E9QAU8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf165E9QAU8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf165E9QAU8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf165E9QAU8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf165E9QAU8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rnf165E9QAU8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf165E9QAU8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rnf165E9QAU8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf165E9QAU8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf165E9QAU8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rnf165E9QAU8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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