Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
6030445D17RikE9Q8F9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms