Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BC005561E9Q5E2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms