Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm20518E9Q548 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms