Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ccdc71lE9Q4T4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ccdc71lE9Q4T4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc71lE9Q4T4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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