Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tarbp1E9Q368 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tarbp1E9Q368 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms