Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
NebE9Q1W3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
NebE9Q1W3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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