Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdr1E9Q0B4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdr1E9Q0B4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms