Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3095E9Q058 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3095E9Q058 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms