Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm20425E9Q035 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm20425E9Q035 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms