Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG4

Crisp4, Cysteine-rich secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp4E9PVG4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp4E9PVG4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms