Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc17E9PVB5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms