Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde2E9PUP1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syde2E9PUP1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms